1、肥料利用率低
充足、適宜的肥料是保證樹體茁壯成長、高產優質以及增強土壤肥力的基礎和有效手段。目前，肥料的利用率很低，氮、磷、鉀肥的利用率僅分別為25%-80%，5%-10%，40%-70%，究其原因主要有：
    直接原因：施用量不當（過多或缺乏），施用時期，地塊（土壤類型及其理化性狀）方法或所用肥料不對癥。
    間接原因：肥料在土壤中淋失、侵蝕、揮發、反硝化（少量）、固定等原因造成的損失。
    因此，針對這些原因，采取科學的對策、合理的栽培技術，是蘋果樹生產實踐中增加元素有效性提高肥效，降低成本，減少污染，提高經濟效益，所急需解決的重要問題。

2、有機肥與無機肥配合施用的問題
自化肥問世以來，就以其營養元素含量高，肥效快，增產效應明顯，用量少、使用方便、經濟效益高等優點而迅速得到大量應用。與此同時，消耗能源、易造成污染，長期使用易惡化土壤理化性狀及結構的缺點，也常常遭到非議。有機肥能改善土壤理化性狀和結構，特別是土壤的物理性狀可在培肥地力。利用農作物、人蓄糞便及城市廢料制成的有機肥，優點是成本低，對諸如鎘鎳等，重金屬有減毒效果，不易造成污染，缺點是養分含量低，用量大，遠距離運輸成本高，增加品質的效應較明顯，但增產效應不夠顯著等。根據樹種及蘋果園條件的不同，篩選有效的有機、無機肥源和肥料形式，確定二者結合使用的適宜的量、比例、施肥時期、施肥方法等，以此達到改良土壤培肥地力高產、優質、高效的效果。

3、元素間不平衡及營養失調問題
    元素不平衡及營養失調問題，除我們平時觀察到的蘋果樹某一組織部位（如果實、葉片、根系）等所表現的元素缺乏或過多造成中毒的癥狀外，實際上還包括癥狀未表現，但蘋果樹體內營養已失調以及樹體各組織部位間元素的不平衡問題。對元素不平衡及營養失調問題的解決依賴于諸多措施的配合。葉片分析對施肥的指導是解決這一問題的有效方法。