有機質來源于有機肥，有機肥來源于有機物，有機物不同，有機肥價格也就不同。下面介紹一下常見菌種的作用：
枯草芽孢桿菌：增加作物抗逆性、固氮。
巨大芽孢桿菌：解磷(磷細菌)，具有很好的降解土壤中有機磷的功效。
膠凍樣芽孢桿菌：解鉀，釋放出可溶磷鉀元素及鈣、硫、鎂、鐵、鋅、鉬、錳等中微量元素。
地衣芽孢桿菌：抗病、殺滅有害菌。
蘇云金芽孢桿菌：殺蟲(包括根結線蟲)，對鱗翅目等節(jié)肢動物有特異性的毒殺活性。
側孢芽孢桿菌：促根、殺菌及降解重金屬。
膠質芽孢桿菌：有溶磷、釋鉀和固氮功能，分泌多種酶，增強作物對一些病害的抵抗力。
菌根真菌：擴大根系吸收面，增加對原根毛吸收范圍外的元素(特別是磷)的吸收能力。
光合菌群：是肥沃土壤和促進動植物生長的主力部隊。
凝結芽孢桿菌：可降低環(huán)境中的氨氣、硫化氫等有害氣體。提高果實中氨基酸的含量。
米曲霉：使秸稈中的有機質成為植物生長所需的營養(yǎng)，提高土壤有機質，改善土壤結構。
淡紫擬青霉：對多種線蟲都有防治效能，是防治根結線蟲最有前途的生防制劑。